营业税改征增值税，是推动经济结构调整、促进发展转型的一项重大改革。“营改增”的指导思想是让行业总体税负不增加或略有下降，旨在减少了企业重复纳税的环节，实质是一项减税政策，有利于促进现代服务业的发展。“营改增”实施初期交通运输业的税负增加是完全可能的;随着时间推移，更多新车辆等交通运输工具的购置进项税准予抵扣，实际税负应该低于征收营业税的税负。现在的税负差异是理论与实际的差异，从长远看，通过抵扣迭加，有利于交通运输业特别是现代服务业的发展。

　　然而，物流业是融合运输业、仓储业、货代业和信息业等的复合型服务产业。在执行营业税制度时，将物流业务划分为交通运输业与服务业两类税目，运输、装卸、搬运税率为3%，仓储、配送、代理等税率为5%;国家为扶持物流企业发展，特别是原本就有部分物流企业在进行差额的营业税试点，实际税负仅为1.8%左右，没有达到理论税负3%。改为征收增值税后，对于一般纳税人来说，装卸搬运服务和货物运输服务税率为11%，物流辅助服务适用税率6%;理论计算税负也就是3%左右。由于会计怕麻烦，把物流辅助服务和货物运输业没有分开核算，导致都按11%计征，显然税负会加重，预测会达到4.5%左右，并不完全由“营改增”税制改革造成的。物流企业现在能开增值税发票，这为下游企业提供进项税，应该能在某种程度上为物流企业，在市场议价方面提供一定的主动权。特别是车辆等固定资产购置进项增值税税准予抵扣，“营改增”非常有利于物流企业长远发展。“营改增”政策的实施，短期内物流企业税负可能会增加。随着时间的推移，更多的进项税准予抵扣，长远看税负是降低的，有利于物流企业的持续发展。物流企业的兼营特点，需执行两档税率，这也迫切要求物流企业更加注重会计培训，提高会计人员素质，加强内部会计核算，进行企业账务系统改造和会计核算流程再造，搞好票据管理，将交通运输业和现代物流辅助业分开核算，便于执行新税制。同时，从国家层面上，需要有关部门加强调研，不断完善“营改增”的政策，由于新增固定资产进项税准予抵扣，因此，应该将交通运输业的存量资产，可以进行模拟测算出进项抵扣税，准予抵扣，有利于原有物流企业健康持续发展。